Medidas de mitigação à pandemia COVID-19: análise de componentes principais hierárquica: construção de ferramenta em Shiny

Abstract

Este estágio curricular foi realizado no âmbito do Mestrado em Estatística Médica da Universidade de Aveiro e tem como finalidade descrever as atividades desenvolvidas durante o seu período no Instituto de Saúde Pública da Universidade do Porto (ISPUP). Durante o estágio houve oportunidade de acompanhar alguns projetos desenvolvidos no ISPUP, fazendo com que fosse possível aprofundar os conhecimentos estatísticos adquiridos ao longo do percurso académico. Para além disso, o estágio permitiu o desenvolvimento de competências técnicas nas áreas da programação de dados e da estatística. O estágio teve como objetivo principal a criação de uma ferramenta interativa, recorrendo ao pacote Shiny disponibilizado pelo RStudio. Esta ferramenta permite analisar e comparar a aplicação, por parte dos países da União Europeia, de medidas de mitigação ao longo do tempo, com o objetivo de controlar a propagação do vírus. Foram, também, comparados os resultados obtidos com os valores de referência (Stringency Index). Os dados usados foram disponibilizados pelo European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), aos quais foi aplicada a Análise de Componentes Principais Hierárquica, agregando entre si as diferentes medidas de resposta. As atividades desenvolvidas durante o estágio permitiram utilizar e consolidar as competências adquiridas durante o ano curricular do Mestrado em Estatística Médica. A possibilidade de trabalhar com dados reais foi crítica para desenvolver competências necessárias para contornar alguns obstáculos, o que permitiu um amadurecimento de competências e, essencialmente, a aprendizagem de novas metodologias.

This curricular internship was carried out within the scope of the Master in Medical Statistics at the University of Aveiro and it aims to describe the activities carried out during the curricular internship at the Institute of Public Health of the University of Porto (ISPUP). During the internship, there was the opportunity to follow some projects developed at ISPUP, making it possible to deepen the statistical knowledge acquired during the academic path. Furthermore, the internship allowed the development of technical skills in data programming and statistics. The main objective of the internship was to create an interactive tool, using the Shiny package provided by RStudio. This tool makes it possible to analyze and compare the application, by European Union countries, of mitigation measures over time, with the aim of controlling the spread of the virus. Furthermore, it was possible to compare the results obtained with the reference values (Stringency Index). The data used were collected by the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). To these data was applied hierarchical principal component analysis, aggregating the different response measures. This internship was important to recall some knowledge acquired during the Master in Medical Statistics. It was also important to be able to work with real data; it was necessary to overcome some obstacles, which allowed a skills maturation and led to the learning of new methodologies.