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http://hdl.handle.net/10773/14127
Título: | Biomarkers in Canis lupus familiaris |
Autor: | Fernandes, Mónica Figueiredo |
Orientador: | Barros, Marlene Maria Tourais de Esteves, Ana Cristina de Fraga |
Palavras-chave: | Microbiologia Cães - Patologias Marcadores bioquímicos Proteómica Bioinformática - Bases de dados |
Data de Defesa: | 2014 |
Editora: | Universidade de Aveiro |
Resumo: | Introdução- Os animais de companhia como o cão desempenham hoje um
papel a nível familiar e social importante podendo atuar como agentes em
programas terapêuticos e de socorrismo.
A qualidade de vida dos animais de companhia e o correspondente impacto na
saúde pública pode beneficiar com o diagnóstico precoce e a intervenção
terapêutica adequada.
Com a evolução das abordagens Ómicas, nomeadamente dos estudos de
proteómica foi gerado um grande volume de dados que retratam o perfil de
proteínas característico de diversas situações patológicas. No entanto a
informação gerada encontra-se dispersa por inúmeros artigos científicos e
também por bases de dados diversas. A reunião de toda a informação
molecular disponível numa única base de dados permitirá a integração da
informação existente, facilitando estudos que visem encontrar os mecanismos
moleculares subjacentes a patologias bem como encontrar biomarcadores que
permitam o diagnóstico precoce de patologias.
Objetivo- Este trabalho tem como objetivo criar uma base de dados que reúna
toda a informação existente sobre os proteomas parciais de Canis lupus
familiaris, o CanisTecOme. Com a construção da estrutura da base de dados
CanisTecOme é demonstrada através de análises diversas in silico, a
metodologia a seguir para extrair informação diversa sobre as proteínas
implicadas em patologias de cão.
Estando interessados em estabelecer a saliva como fluido de diagnóstico não
invasivo, foi também objetivo desta tese o estabelecimento da metodologia
para a recolha, armazenamento e caracterização de amostras de saliva de
cão.
Materiais e métodos- A base de dados CanisTecOme foi construída por
recurso a revisão e anotação manual sobre a informação relativa à
caracterização do individuo dador, tipo de amostra biológica, técnicas
utilizadas para a identificação da proteína, e toda a informação conhecida
sobre cada uma das proteínas catalogada na base de dados. O CanisTecOme
tem também anotado as proteínas que já foram propostas como
biomarcadores para patologias diversas.
A metodologia para o estabelecimento da recolha, armazenamento e
caracterização das amostras de saliva de cão foi baseada na já estabelecida
para a saliva humana.
Conclusão- A estrutura proposta para a base de dados CanisTecOme permite
responder a questões como identificar:
- As patologias em cão para as quais existe informação sobre as
proteínas implicadas;
- Os mecanismos moleculares comprometidos em patologias;
- A saliva contém proteínas que permitam identificar patologias
sistémicas?
No que diz respeito à metodologia estabelecida para a recolha,
armazenamento e caracterização de amostras de saliva esta mostrou-se com
a qualidade adequada para o estabelecimento de um futuro biobanco de saliva
animal. Introduction – Pets such as the dog are important for families and for society in general acting as therapeutic agents and rescue aids. Pets quality of life and the correspondent effect on public health may benefit from early diagnostics and targeted therapeutic actions. The evolution of the Omics sciences, including proteomics resulted in the accumulation of a large volume of data reflecting the protein profile of different pathological situations. However, the information generated is dispersed throughout several scientific articles and data bases. Collecting all information in a single database allows data integration and management used in studies to find molecular biomarkers for early diagnosis. Goal - To create a database with all information on the partial proteomes of Canis lupus familiaris, the CanisTecOme. The methodology to be used in for data management and information gathering using the CanisTecOme database is demonstrated through different in silico analysis. A second objective of this work was the outlining of the basic methodology for dog saliva collection, storage and characterization. This allows the use of saliva as a minimally invasive diagnostic fluid. Materials and methods – Manual curation and annotation of all the information related to the saliva donor, biological sample, techniques used for protein identification and all the information related to the protein identifies was performed. The CanisTecOme has also indicated whether a protein has already been proposed as a biomarker. The methodology for the establishment of the sampling, storage and sample characterization of dogs saliva was based on what is already established for human saliva. Conclusion – The structure proposed for the database enables the answer to the following questions: -Which proteins have been identified in the dog as being present in a pathology? - Which molecular mechanisms are compromised in a pathological situation? - Are there protein in saliva which allow the identification of systemic pathologies in the dog? Furthermore, the methods used for sampling, transport and storage of saliva were adequate for the establishment of a saliva biobank for animal saliva. |
Descrição: | Mestrado em Microbiologia |
URI: | http://hdl.handle.net/10773/14127 |
Aparece nas coleções: | UA - Dissertações de mestrado DBio - Dissertações de mestrado |
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