Caracterização de comunidades de bactérias endofíticas de Salicornia ramosissima da Ria de Aveiro

Abstract

As plantas halófitas sobrevivem em ambientes de elevada salinidade com recurso a várias estratégias, sendo uma delas, a associação com bactérias que contribuem para o seu crescimento e tolerância ao stresse. As bactérias que colonizam tecidos das plantas sem lhes causarem dano designam-se como endofíticas. O objetivo deste trabalho foi contribuir para uma melhor compreensão da relação entre a halófita Salicornia ramosissima e as comunidades de bactérias endófitas associadas às suas raízes e a identificação de fatores bióticos e abióticos relevantes na estrutura e composição destas comunidades. A riqueza, diversidade e composição das comunidades de bactérias endofíticas cultiváveis e não cultiváveis foi investigada em 3 locais da Ria de Aveiro, representativos de diferentes condições físico-químicas e graus de intervenção humana. A riqueza e diversidade de bactérias endofíticas de S. ramosissima avaliada por métodos dependentes e independentes de cultivo, foi maior em locais mais salinos. A abordagem dependente de cultivo permitiu obter uma coleção de isolados nos quais foram identificados representantes das classes Actinobacteria, a-Proteobacteria, y- Proteobacteria e Bacilli. A abordagem independente de cultivo permitiu detetar a presença de 1 classe de Archaea (Candidatus Woesearchaea) e 13 classes de Bactéria, com predomínio de a-Proteobacteria, y-Proteobacteria, Bacteroidia e Acidimicrobiia. Os resultados demonstram a elevada diversidade e variabilidade das comunidades de bactérias endofíticas da raíz de S. ramosissima, bem como o efeito do hospedeiro e de fatores físico-químicos dos sedimentos na sua estrutura e composição .

Halophytes survive in high salinity environments using several strategies, one of which is the association with bacteria that contribute to their growth and tolerance to stress. Bacteria that colonize plant tissues without causing damage are called endophytes. The aim of this work was to contribute to a better understanding of the relationship between the halophyte Salicornia ramosissima and the communities of endophytic bacteria associated with its roots and the identification of relevant biotic and abiotic factors as drivers of the structure and composition of these communities. The endophytic bacterial richness, diversity and composition of the culturable and non culturable fractions was investigated at three sites, within the estuarine system Ria de Aveiro, representing different physical-chemical conditions and degrees of human impact. The richness and diversity of S. ramosissima endophytic bacteria, as assessed either by culture dependent or culture-independent methods, was higher in the most saline sites. The culture-dependent approach provided a collection of isolates in which representatives of the classes Actinobacteria, a-Proteobacteria, y-Proteobacteria and Bacilli were represented. The culture-independent approach, allowed the detection of 1 class of Archaea (Candidatus Woesearchaea) and 13 classes of Bacteria, with a predominance of a-Proteobacteria, y-Proteobacteria, Bacteroidia and Acidimicrobiia. The results demonstrate the high diversity and variability of the communities of endophytic bacteria, as well as the effect of host-specific and sediment-specific factors on their structure and composition.