GeNS : the genomic name server

Abstract

Os desenvolvimentos científicos vindo do campo da biologia molecular dependem em grande parte da capacidade de análise de resultados laboratoriais por parte de aplicações informáticas. Uma análise completa de uma experiência requer, tipicamente, o estudo simultâneo dos resultados obtidos a par com dados disponíveis em várias bases de dados públicas. Fornecer uma visão unificada deste tipo de dados tem sido um problema fundamental na investigação ao nível de bases de dados desde o aparecimento da Bioinformática. Esta dissertação apresenta o GeNS, um data warehouse híbrido com uma abordagem simples e inovadora que pretende resolver diversos problemas de integração de dados biológicos.

ABSTRACT: The scientific achievements coming from molecular biology depend greatly on the capability of computational applications to analyze the laboratorial results. A comprehensive analysis of an experiment requires, typically, the simultaneous study of the obtained results with data that is available from distinct public databases. Being able to provide a unified view of this data has been a fundamental problem in database research since the dawn of Bioinformatics. This dissertation introduces GeNS, a hybrid data warehouse that presents a simple, yet innovative approach to address several biological data integration issues.