Diversity of Botryosphaeriaceae species on plants from the Rostov region (Russia)

Abstract

Este estudo teve como objectivo avaliar a diversidade de espécies da família Botryosphaeriaceae, usando uma abordagem multifacetada combinando dados morfológicos e moleculares, associadas a uma grande e diversa coleção de amostras de plantas hospedeiras provenientes da região de Rostov na Rússia. Os fungos isolados foram inicialmente analisados por reação em cadeia de polimerase usando primer BOX para avaliar a diversidade genética global dos isolados. Isolados representativos de cada grupo foram selecionados para posterior identificação filogenética combinando duas regiões de ADN, usando o espaçador interno transcrito (ITS) em conjunto com o factor de elongamento de transcrição 1-alfa (EF1-α). Os resultados revelaram três géneros, Diplodia, Dothiorella e Phaeobotryon. Dothiorella foi o género mais representado e prevalente de toda a coleção e a espécie Dothiorella sarmentorum claramente mais dominante. Duas potenciais novas espécies foram identificadas neste trabalho, uma espécie pertencente ao género Dothiorella e uma outra ao género Phaeobotryon. Várias espécies identificadas foram relatadas pela primeira vez na Rússia e em vários hospedeiros diferentes.

This study aimed to assess the diversity of Botryosphaeriaceae species associated with a large and diverse collection of plant hosts from the Rostov region in Russia, using a polyphasic approach combining morphological and molecular data. Fungal isolates obtained were initially subjected to a fingerprinting by BOX-PCR in order to evaluate the overall genetic diversity of the collection. Selected isolates representative of each group were further identified by a phylogenetic approach combining two gene regions, the internal transcribed spacer (ITS) of the ribosomal DNA cluster and part of the translation elongation factor 1-alpha (EF1-α). The results revealed three genera, namely Diplodia, Dothiorella and Phaeobotryon. Dothiorella was the most represented and prevalent genus throughout the samples studied and the species Dothiorella samentorum was clearly dominant. Two putative new species were identified in this work, one from the genus Dothiorella and another from Phaeobotryon. Several of the species are reported from Russia for the first time a large number of new host associations were identified.