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http://hdl.handle.net/10773/25453
Title: | Diversity and antimicrobial potential of bacteria isolated from Algarve caves |
Other Titles: | Diversidade e potencial antimicrobiano de bactérias isoladas de grutas do Algarve |
Author: | Veloso, Telma Luísa Machado |
Advisor: | Sérgio Miguel Reis Luís Marques Helena Cristina Correia de Oliveira Fernando Mendes Gonçalves |
Keywords: | Caves Diversity Bacteria Antimicrobial activity |
Defense Date: | 17-Dec-2018 |
Abstract: | Recently, the need for new molecules with antimicrobial activity increased due
to a continuous the increasing number of multi drug resistant pathogenic
bacteria. To fill this urging need, the scientific community has made a great
investment in searching for new microorganisms and their bioactive
compounds. A great part of the effort has been focused in environments with
extreme conditions, since in these environments the inhabiting microorganisms
must have very particular features. Karstic caves are considered extreme
environments due to the nutrient scarcity caused by absence of natural light
that precludes the growth of vascular green plants. In addition, the relatively
low and stable temperature and the high humidity levels, force cave dwelling
microorganisms to become highly specialized. The fact that these unique
habitats are poorly studied, in particular when considering the bacterial
community, makes them a potential reservoir for both new species and new
antimicrobial compounds, as demonstrated in the few existing studies.
Considering these facts our study aimed at: i) obtain and identify bacterial
isolates sampled in three caves of Algarve, namely Vale do Telheiro, Senhora
and Ibne Ammar and, ii) assess their antimicrobial activity.
From the collected samples of the three caves we are able to isolate 110
bacterial isolates. After sequencing and searching for homologies in the
databases it was possible to include the isolates in phyla, namely Firmicutes,
Proteobacteria and Actinobacteria, in a total of 19 genera. Regarding the
antimicrobial activity, the tests were performed against six test agents:
Escherichia coli ATCC 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853,
Staphylococcus aureus ATCC 25923, Enterococcus faecalis ATCC 29212,
Aeromonas salmonicida ATCC 33658 and Bacillus cereus ATCC 14579. The
results revealed that approximately 52% of the bacterial isolates presented
antimicrobial activity against at least one test agent, and that ten bacterial
isolates were able to inhibit the growth of more than four test agents.
This study was the first to focus cultivable bacterial diversity in the Algarve
caves and confirmed that prospection for new antimicrobial compounds in
subterranean environments might be one of the strategies for fighting the
problem of multi drug resistant bacteria. Recentemente, a necessidade de novas moléculas com atividade antimicrobiana aumentou devido ao contínuo aumento do número de bactérias patogénicas com resistência aos vários antibióticos disponíveis no mercado. Para colmatar esta necessidade, a comunidade científica tem realizado esforços na procura de novos microrganismos e dos seus compostos bioativos. Grande parte do esforço tem sido concentrado em ambientes com condições extremas, uma vez que nestes ambientes os microrganismos que os habitam têm de ter características muito específicas. As grutas cársicas são consideradas ambientes extremos uma vez que a ausência de luz natural impede o crescimento de plantas, fazendo com que o ambiente seja caracterizado por elevada escassez nutritiva. Juntamente com a elevada humidade e a temperatura relativamente baixa e constante, faz com os microrganismos que habitam estes ambientes se tornem altamente especializados. O facto destes habitats únicos serem pouco estudados, nomeadamente no que diz respeito à comunidade bacteriana, torna-os num potencial reservatório, tanto de novas espécies como de novos compostos antimicrobianos, tal como demonstrado nos poucos estudos existentes. Considerando estes factos, os objetivos deste estudo foram: i) obter e identificar isolados bacterianos recolhidos em três grutas do Algarve nomeadamente, as grutas do Vale do Telheiro, da Senhora e do Ibne Ammar e ii) avaliar se os mesmo têm atividade antimicrobiana. A partir das amostras recolhidas nas três grutas, foram isoladas 110 estirpes bacterianas. Após sequenciação e pesquisa de similaridades em bases de dados foi possível verificar que os isolados bacterianos pertencem a três filos, nomeadamente Firmicutes, Proteobacteria e Actinobacteria, num total de 19 géneros diferentes. Em relação à actividade antimicrobiana, os testes foram realizados contra seis agentes teste Escherichia coli ATCC 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Staphylococcus aureus ATCC 25923, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Aeromonas salmonicida ATCC 33658 e Bacillus cereus ATCC 14579. Os resultados revelaram que aproximadamente 52% dos isolados apresentam atividade antimicrobiana contra, pelo menos, um agente teste e que, 10 isolados foram capazes de inibir o crescimento de mais de 4 agentes teste. Este estudo foi o primeiro a focar a diversidade bacteriana cultivável de grutas do Algarve e confirmou que a prospeção de compostos antimicrobianos em ambientes subterrâneos poderá ser uma das estratégias para combater o problema da resistência aos antibióticos. |
URI: | http://hdl.handle.net/10773/25453 |
Appears in Collections: | UA - Dissertações de mestrado DBio - Dissertações de mestrado |
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