Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/10773/25363
Title: | Evaluation of the antimicrobial activity from Cerâmica Cave (Portugal) bactéria : the case study of Cupriavidus sp. |
Other Titles: | Avaliação da atividade antimicrobiana de bactérias da Gruta de Cerâmica (Portugal) : o caso de estudo de Cupriavidus sp. |
Author: | Gouveia, André Alexandre Grangeia |
Advisor: | Gonçalves, Fernando Sérgio Miguel Marques |
Keywords: | Cave systems Cerâmica Cave Bacteria Antimicrobial activity In vitro screening Cupriavidus sp., Pigments Culture media |
Defense Date: | 17-Dec-2018 |
Abstract: | Presently, the increasing number of multidrug resistant pathogens continues
to be one of the major issues to be tackled by the scientific community. This is
aggravated by the inability to find antibiotics with new chemical structures and/or
modes of action. Therefore, the search for novel metabolites has expanded to
the prospection of bacterial drug producer’s strains in extreme environments
such as caves. Caves differ from surface environments in some of their core
aspects, creating an extreme and unfavourable environment for microorganisms.
The absence of light, high humidity and typical lack of nutrient input creates
oligotrophic niches throughout the cave, with high potential for harbouring unique
and unexplored microbial populations. Caves represent, thereby, a reservoir of
unknown bacterial diversity potentially with antibiotic producing organisms.
Additionally, few caves have been explored with the specific focus of finding
these microorganisms. Taking this into consideration, this work focused on the
antimicrobial activity of bacterial strains isolated from cave systems. The specific
objectives of this work were: i) to review the methods used in the isolation of drug
producer strains as well as in the evaluation of in vitro antibacterial activity ii) to
identify and screen for antimicrobial activity bacterial strains isolated from
Cerâmica Cave, Portugal; iii) to modulate the production of antimicrobial
compounds and pigments by isolate CC166 (Cupriavidus sp.) and assess their
bioactivity.
An extensive review was made leading to the conclusion that caves may be
one of the next most promising niches for novel drug producer bacterial strains.
Among the isolation methods employed, the use of supplements, a wide variety
of culture media and pre-treatments has been successfully applied in the
isolation of drug producer strains. Based on the literature, the disk diffusion
method and the agar well diffusion assay have been successfully employed on
the screening for drug producer strains.
Through the tackling of the second objective, antibiotic producer bacteria
belonging to several genera were revealed. These included Streptomyces,
Cupriavidus, Bacillus and Paenibacillus. Regarding the third objective, the
employment of several culture media revealed remarkable patterns in the
antimicrobial activity as well as in the modulation of pigments by Cupriavidus sp.
CC166. Notably, Cupriavidus sp. CC166 was able to inhibit all pathogenic
bacteria used as test agents in this work. Atualmente, o contínuo aumento de organismos patogénicos multirresistentes é uma das maiores problemáticas que a comunidade científica enfrenta. Isto é acentuado pela incapacidade de encontrar antibióticos com novas estruturas químicas e/ou modos de ação. Por este motivo, a procura por novos metabolitos tem vindo a expandir-se para a prospeção de novas estirpes bacterianas produtoras de antibióticos em ambientes extremos, tais como grutas. Os ambientes cavernícolas diferem dos de superfície em alguns aspetos chave, sendo responsáveis por criar um ambiente extremo e menos favorável para os microrganismos. A ausência de luz, a elevada humidade e a típica falta de nutrientes gera nichos oligotróficos, ao longo da gruta, com elevado potencial para possuir populações microbianas únicas e não exploradas. Por este motivo, estes ambientes representam um reservatório desconhecido de diversidade bacteriana, potencialmente com organismos produtores de antibióticos. Adicionalmente, poucas grutas foram exploradas com o foco específico de encontrar estes microrganismos. Por este motivo, este trabalho focou-se na atividade antimicrobiana de estipes bacterianas isoladas a partir de sistemas cavernícolas. Os objetivos específicos deste trabalho foram: i) a revisão dos métodos usados na obtenção de estirpes com atividade bacteriana, assim como nos métodos usados na avaliação das atividades antibacterianas; ii) a identificação e avaliação de atividade antimicrobiana de estipes bacterianas isoladas a partir da Gruta da Cerâmica, Portugal; iii) modular a produção de compostos antimicrobianos e pigmentos pelo isolado CC166 (Cupriavidus sp.) assim como avaliar as suas bioatividades. Foi realizada uma extensa revisão bibliográfica, que resultou na conclusão de que os ambientes cavernícolas podem ser um dos próximos nichos mais promissores para a descoberta de estirpes bacterianas produtoras de novos metabolitos. Entre os métodos de isolamento empregues, o uso de suplementos, de uma grande variedade de meios de cultura e de pré-tratamentos, têm sido aplicados com sucesso no isolamento de estirpes produtoras de antibióticos. Com base na literatura, os métodos mais aplicados na avaliação da atividade antimicrobiana das estirpes bacterianas incluem o método disco-difusão e o método de difusão em ágar por poço. Através da realização do segundo objetivo, várias bactérias produtoras de antibióticos pertencentes a diversos géneros foram reveladas. Estes incluíram os géneros Streptomyces, Cupriavidus, Bacillus e Paenibacillus. Relativamente ao terceiro objetivo, o uso de vários meios de cultura revelou padrões de atividade antimicrobiana notáveis, assim como de modulação de pigmentação por Cupriavidus sp. CC166. Notavelmente, Cupriavidus sp. CC166 demonstrou a capacidade de inibir todas as bactérias patogénicas testadas neste trabalho. |
URI: | http://hdl.handle.net/10773/25363 |
Appears in Collections: | UA - Dissertações de mestrado DBio - Dissertações de mestrado |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
documento.pdf | 2.67 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.