GeneBrowser : sistema de recuperação de dados biológicos

Abstract

O uso de técnicas computacionais tem sido um aspecto decisivo no avanço da biologia molecular e genética. Toda a pesquisa moderna da biologia molecular não seria possível sem a computação. Da sinergia existente entre estas duas ciências surgiu um novo campo do conhecimento - a bioinformática. A sequenciação do genoma humano e de outros organismos criou uma enorme quantidade de dados, o que levou à necessidade de criar novas aplicações para processar e extrair informação destes dados. Esta dissertação teve como objectivo, planear e desenvolver uma solução computacional que permitisse uma melhor interpretação biológica de um conjunto de genes. O sistema construído, GeneBrowser, agrega diversos serviços e fontes dados públicos, e utiliza métodos estatísticos para evidenciar o enriquecimento funcional das classes que descrevem os genes e os seus produtos.

ABSTRACT: The use of computational techniques is a decisive aspect in the advances of molecular biology and genetics. All the modern research in molecular biology was not possible without the computation techniques. With the synergy between the two sciences a new field of knowledge appeared – bioinformatics. With the sequencing of the human genome and other organisms, a huge amount of data was created, this brought the need of new applications for process and extract knowledge from this data. This work had as objectives, to plan and develop a computational solution that provides a better biological interpretation of a set of genes. The system built, GeneBrowser, adds several services and public data sources, and uses statistical methods to demonstrate the functional enrichment of the classes that describe the genes and their products.