Valor do MALDI-TOF no diagnóstico bacteriológico na fibrose quística

Abstract

A fibrose quística é a doença hereditária autossómica recessiva frequentemente associada à raça caucasiana. Atualmente, a principal causa de morbilidade e mortalidade é o declínio gradual da função pulmonar devido à colonização crónica por diversas bactérias e fungos, onde os bacilos Gram negativo não fermentadores têm um papel fundamental. O objetivo deste trabalho é comparar duas tecnologias diferentes de identificação bacteriana, na sua capacidade de fornecer uma identificação o mais completa e fidedigna possível, dos bacilos de Gram negativo não fermentadores, em doentes com fibrose quística. Dentro deste objetivo, pretendia-se avaliar o impacto e possível introdução da tecnologia MALDI-TOF MS na rotina de um grande hospital. Para isso, foi realizada uma recolha de dados dos resultados bacteriológicos das amostras respiratórias de 85 doentes com fibrose quística do Centro Hospitalar de São João, EPE. De janeiro de 2002 a 28 de fevereiro de 2013 foram analisados os microrganismos isolados em 1000 amostras, utilizando o VITEK® 2, onde 77,5% dos isolamentos foram identificados ao nível da espécie, 12% ao nível do complexo e 6,7% ao nível do género, não tendo identificado a bactéria em 3,8%. Entre 01 de março de 2013 e 08 de agosto de 2014 foram analisadas 175 amostras usando o VITEK® MS, obtendo uma identificação ao nível da espécie em 73,1% das vezes, 6,3% ao nível do complexo e 20,6% ao nível do género. Assim, é possível concluir que a introdução da tecnologia MALDI-TOF MS permitiu um melhoramento na identificação bacteriana, com a vantagem de fornecer uma identificação fidedigna em apenas alguns minutos e utilizando uma pequena quantidade de inóculo. No entanto, constatou-se que há necessidade de melhorar a base de dados para alguns géneros de bacilos Gram negativo não fermentadores, de forma a possibilitar uma identificação ainda mais eficaz.

Cystic fibrosis is the most frequent autossomic recessive hereditary disease in Caucasian race. Gradual decline of pulmonary function originated by chronic bacteria and fungi colonization is the leading cause of morbidity and mortality in cystic fibrosis and non-fermenters bacilli have a fundamental role in the colonization. The objective of this work is compare two different bacteria identification technologies through the ability to provide the most complete and reliable identification possible of non-fermenters Gram negative bacilli in cystic fibrosis patients. Within this aim, the intention was evaluate the impact and possible introduction of MALDI-TOF MS technology in the routine of a large hospital. To achieve that goal, a data collection of bacteriological results from respiratory samples of 85 cystic fibrosis patients from Centro Hospitalar de São João, EPE was performed. Between January 02 2002 and February 28 2013, microorganisms isolated in 1000 samples were analysed using VITEK® 2, which identified at species level in 77.5%, 12% at complex level and 6.7% at genus level, and in 3.8% of cases no identification was made. Between March 01 2013 and August 08 2014 have been analysed 175 samples using VITEK® MS and it proceed the identification at species level in 73.1%, 6.3% at complex level and 20.6% at genus level. Thus, it is possible to conclude that MALDI-TOF MS technology has enabled an improvement in bacterial identification, taking the advantage of providing an identification in just a few minutes. However, it is necessary to improve the database for some genera of non-fermenters Gram negative bacilli, in order to permit a more efficient identification.