Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10773/10135
Title: Characterization of mammal salivary peptides
Other Titles: Caracterização dos péptidos salivares de mamíferos
Author: Pereira, Patrícia de Sousa
Advisor: Vitorino, Rui Miguel Pinheiro
Esteves, Pedro José de Castro
Keywords: Métodos biomoleculares
Saliva - Mamíferos
Péptidos
Proteínas
Defense Date: 28-Jul-2012
Publisher: Universidade de Aveiro
Abstract: A saliva e os seus componentes desempenham diversas funções na cavidade oral, tais como lubrificação, proteção dos tecidos orais e ação antimicrobiana. Entre os componentes responsáveis por esses papéis estão diversos péptidos cuja evolução e presença na saliva de outras espécies de mamíferos não está clara. No presente trabalho, duas classes destes péptidos, as cistatinas salivares e a timosina β4, foram analisadas usando ferramentas de genómica e de proteómica em conjunto. Para os estudos de proteómica foi colhida saliva de cão, rato, coelho e cordeiro, sendo a separação dos péptidos presentes feita por cromatografia liquida e a análise por espectrometria de massa tandem. Para os estudos de genómica foram pesquizadas bases de dados de sequências nucleotídicas e realizaram-se análises evolutivas. No que diz respeito à timosina β4 demonstrou que este péptido apresenta uma elevada conservação entre as diferentes espécies de mamíferos. Utilizando as sequências deste péptido encontradas no genoma dos diferentes mamíferos, foi possível identificar pela primeira vez por espectrometria de massa a timosina β4 na saliva do cão. No caso da classe das cistatinas, nomeadamente cistatinas C, D e tipo-S (S, SA e SN), a análise evolutiva permitiu verificar que as cistatinas D e tipo-S são específicas dos primatas, o que sugere que terão emergindo após a grande separação dos mamíferos que ocorreu há cerca de 80-90 milhões de anos. Os resultados permitiram também verificar que algumas sequências presentes nas bases de dados encontram-se mal anotadas, incluindo a sequência atribuída à cistatina S encontrada no rato. Por outro lado, a análise filogenética demonstrou que a cistatina C está distribuída por várias classes de mamíferos. No entanto, permanece por compreender o mecanismo da sua secreção na saliva humana e a sua ausência na saliva de outras espécies de mamíferos. Em conclusão, através da combinação da proteómica e filogenia podemos caracterizar e compreender a distribuição dos péptidos salivares em diferentes mamíferos e comparar com toda a informação existente para a saliva humana.
Saliva and its components play several roles in the oral cavity, such as lubrication, protection of tissues and antimicrobial action. Among the components responsible for these roles are several peptides, which evolution and presence in other mammals’ saliva is not clear. In the present study, two peptide classes, salivary cystatins and thymosin β4, were analyzed using a combination of genomic and proteomic tools aiming the enlightening changes in the structure and distribution of these peptides between the different mammal species. For the proteomic analysis, saliva was collected from dog, rat, rabbit and lamb, being salivary peptides separated by chromatography and analyzed by tandem mass spectrometry. For the genomic studies, database of nucleotide sequences were searched and evolutionary analyses were performed. Regarding thymosin β4, the evolutionary analysis showed that this peptide is highly conserved through the collection of all peptide sequences from different mammals species genome, it was possible to identify for the first time by mass spectrometry the thymosin β4 in dog’ saliva. Respecting cystatins class, namely C, D and S-type cystatins (S, SA and SN), evolutionary analysis showed that D and S-type cystatins are Primate specific, which suggesting that these classes emerged after the great mammalian radiation at 80-90 million years ago. The results also showed errors in the annotation of these sequences in databases, in particular the sequence attributed to cystatin S detected in rat. In contrast, evolutionary analysis showed that cystatin C is widely distributed in several mammal classes. However, it is not clear their secretion mechanism to saliva and why its absence in saliva of other mammal’ species. In conclusion, using phylogenetic and proteomic approaches it will be possible to understand and characterize the distribution of these peptides in different mammal species and compare with what is known in the human saliva.
Description: Mestrado em Bioquímica
URI: http://hdl.handle.net/10773/10135
Appears in Collections:UA - Dissertações de mestrado
DEP - Dissertações de mestrado

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