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  Repositório Institucional da Universidade de Aveiro > Departamento de Electrónica, Telecomunicações e Informática > DETI - Dissertações de mestrado >
 Computational methods for microarray data analysis
Please use this identifier to cite or link to this item http://hdl.handle.net/10773/3989

title: Computational methods for microarray data analysis
other titles: Métodos computacionais para análise de dados de microarrays
authors: Teixeira, Bellina Ribau
advisors: Oliveira, José Luís Guimarães
keywords: Engenharia de computadores
Micromatrizes de ADN
Expressão genética
Bioinformática
Software de computadores
issue date: 2009
publisher: Universidade de Aveiro
abstract: Os microarrays de ácido desoxirribonucleico (ADN) são uma importante tecnologia para a análise de expressão genética. Permitem medir o nível de expressão de genes em várias amostras para, por exemplo, identificar genes cuja expressão varia com a administração de determinado medicamento. Um slide de microarray mede o nível de expressão de milhares de genes numa amostra ao mesmo tempo e uma experiência pode usar vários slides, surgindo assim muitos dados que é preciso processar e analisar, com recurso a meios informáticos. Esta dissertação inclui um levantamento de métodos e recursos de software utilizados na análise de dados de experiências de microarrays. Em seguida, descreve-se o desenvolvimento de um novo módulo de análise de dados que visa, usando métodos de identificação de genes diferencialmente expressos, identificar genes que se encontram diferencialmente expressos entre dois ou mais grupos experimentais. No final, é apresentado o trabalho resultante, a nível de interfaces gráficas e funcionamento.

Deoxyribonucleic acid (DNA) microarrays are an important technology for the analysis of gene expression. They allow measuring the expression of genes among several samples in order to, for example, identify genes whose expression varies with the administration of a certain drug. A microarray slide measures the expression level of thousands of genes in a sample at the same time, and an experiment can include various slides, leading to a lot of data to be processed and analyzed, with the aid of computerized means. This dissertation includes a review of methods and software tools used in the analysis of microarray experimental data. Then it is described the development of a new data analysis module that intends, using methods of identifying differentially expressed genes, to identify genes that are differentially expressed between two more groups. Finally, the resulting work is presented, describing its graphical interface and structural design.
description: Mestrado em Engenharia de Computadores e Telemática
URI: http://hdl.handle.net/10773/3989
appears in collectionsDETI - Dissertações de mestrado
UA - Dissertações de mestrado

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